这边，山和尔找到天书商议造船回中原。建康城里，司马文思案被交付周廷尉审理，上面暗示，作谋反论处，仵作验尸后来报，尸体上的伤口为剑伤，一剑致命。
审案中，证人众口一词地说，死者当时身穿杂役服饰，正在打扫，谯王看他干活不认真，东张西望，大声询责，死者不服，出言顶撞，一个仆人居然敢反驳谯王，犯了大不敬之罪，谯王吩咐我们拿下鞭打二十，死者奋力反抗，打伤二人，谯王大怒，拨剑刺出，谁知正中要害，当场毙命。高官显贵腰佩开锋了的长剑为朝廷礼仪所允许，无法以私藏兵器意图谋反论罪，死者身份为现役武官，可又没亮出腰牌表明身份，滥杀官吏的罪也加不上。
案件现场虽然还有一些疑点，相对于刘裕，周廷尉在内心深处更偏重于司马氏，毕竟司马氏才是晋朝的正宗，所以，以不明对方身份下，擅杀官吏结案。
看着周廷尉送来的案卷，刘穆之也在细细地推敲着，细作来报有三百人报名就学，可围捕时只有原来的学生五十余名及门客十余人，司马文思，司马文宝，司马文祖三人虽武功不错，但年轻气盛，没有这么深谋远滤，必有高人指点，正想时，又有细作来报，韩延之到建康后只一天就匆匆离去，原来是他从中作梗，此人智谋不在我之下，这次没抓到他们聚众谋反的实证，暂时只能从轻处理，不然，难以服众。
义熙十年三月，皇帝下诏赦免司马文思，但将他的门客十数人全部诛杀，军校解散。
司马休之听说儿子犯案，上书请罪，臣休之言：圣人云，子不教，父之故也。犬子文思，品性顽劣，擅杀官吏，是休之教子无方引起的，罪在朝廷。
臣才疏学浅，无大功于朝廷，而朝廷娄次封赏，得蒙授以荆州刺史之重任，自到任以来，事无巨细，亲力亲为。只望尽心竭力，以报朝廷恩德。今以臣之子有失教悔，使得家门蒙羞，请求辞去荆州刺史职务，另守贤明之士。
陛下洪汤、禹之仁，务宽大之典，愚臣感思戴德，将专心闭门教子，枕戈嚐胆，肝脑涂地，少答鸿私。
朝廷下诏给司马休之不准辞职，随后，刘裕命人将司马文思押送江陵，交给司马休之处置，准备看他大义灭亲。
司马休之，司马文思，韩延之三人密议，司马文思慨然作答，”刘裕想篡夺我司马氏的天下已久，儿臣一事只是他计划内的一步棋而已，不杀儿臣，弟弟司马文宝在建康为质，恐有不测之祸，如儿臣之死能为父亲赢得备战时间，儿臣愿意以血奠我大晋江山。”
“”方寸已乱，还请先生有以教我。”司马休之向韩延之投过去一个求助的眼神。朝延之略一思索后回复：“欲加之罪，何患无词，即使谯王就死，刘裕也不肯善罢干休，司马文宝依然无法脱离刘裕的掌握，生死掌于他人之手。并且，主公只善文治，不通武功，谯王一死，武备乏人，即使赢得时间，无益于备战。杀子求存，必将引起官吏恐慌，士卒寒心，荆州人心分崩离析。当今之计，不如整兵备战，同时上表请求废去司马文思的谯王爵位，希望能略延时日。
主公仁德之名播于海内，到任荆州后，精励图治，天下可见，并且深得荆州民心，此可以一战的原因之一，唇亡齿寒，鲁宗之有大功与朝廷，可与主公一般受刘裕猜疑，在下愿意为主公游说鲁宗之与我们共抗刘裕，此其二，如再能得后秦与北魏为援，谁胜谁负，还是未知数，此其三。”
司马休之乃遣使上表朝廷曰：臣闻天无所不覆，地无所不载。王者体天法地，于人无所不容。臣荷主上覆载之德旧矣，不敢自绝于天地，故一陈愚衷。臣本庸才，遭时多故，教子无方，以至子司马文思胡作非为，有违朝廷法度。今请朝廷废去司马文思谯王之职，臣将把犬子禁足于府内，不使诺事生非，将以依日月之末光，望雨露之余润。臣遵奉条约，不敢妄生节目。
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