与洛阳一同落入晋军手中的还有四千多后秦俘虏。此时，有人向檀道济提出把俘虏全部坑杀，然后将尸体堆积在一起，外面再盖上浅浅一层土，筑成小山。这种用尸体堆成的人工小山当时称之为“京观”，用于夸耀武功。
禪山听到这个消息后大惊，想起共产党优待俘虏收得人心的政策，急急赶到大帐内对檀道济说：“当严惩出主意之人。本次北伐不仅仅为杀敌，更为了收复故土，杀千人扬威而失德，民心离散，百姓逃亡，即使得到土地，也只将是荒漠一片。”
檀道济同样认为洛阳已下，这种杀戮有害无益，便堂堂正正地回答说：“所谓仁义之师，吊民伐罪，正要在今天体现！”随后将这些被俘的后秦士兵全部释放，遣送他们回家。河南一带民众，不论胡汉，对晋军这一举动都心悦诚服，纷纷归附。
而姚泓派来的援军阎生率部至新安，姚益男率部前进到湖城，听说洛阳已被晋军攻克，都不敢再前进。刘裕制定的第一阶段战略目标，只用了短短两个月时间已基本完成。
洛阳既复，下一步的行动是剑指长安，进一步利用敌人的内部矛盾来缓解对手，才是最高明的外交策略，姚家兄弟不和，个个都想过把皇帝瘾，那么，我们再给他们添把火吧，禪山与檀道济商议，这火该由那里扇起？对皇位有企图的皇弟之一是坐镇蒲阪掌控河东的后秦并州牧姚懿。
于是，河东地区谣言四起，都说姚泓无能，即位才不到一年，已经把父皇留下的疆土丢失了近一半，当有新君出才能挽国家于危亡。
司马孙畅听到谣言后，认为天意里的新君指的就是姚懿，给他指出的行动计划分两步。
第一步，在大哥丧失威信的时候，开仓放粮，尽全力收买人心，以造成和当今皇上的鲜明对比，取得民意基础。
第二步，以“众望所归”之势，发兵突袭关中，诛杀姚绍，废黜姚泓，正大位于长安！
放粮可不是个小举动，他大哥姚泓想不知道都不可能了。无可奈何之下，姚泓只得将叔父姚绍找来，密商对策。和这些侄子比起来，姚绍的智商要高得多了，他一眼便看穿了那位并州牧的底牌：“姚懿一向愚昧无知，见识浅陋，自己没什么主见。现在给他出这些坏主意的人一定是孙畅。朝廷可以马上下旨，征召孙畅入京，断其奸谋，同时再派抚军将军姚赞进驻陕城，威胁其侧背，老臣我则赶往潼关节制诸军。孙畅如果接受征召最好，我就集合姚懿的河东部队共同东进，抵御晋军；如果他们拒不从命，则我立即公开他们的罪行，就近出兵讨伐！”
很快，姚懿便接到了关于将孙畅调往长安工作的人事命令，也得知政府军正向陕津、潼关一带集结，叔父姚绍正在赶来的消息。形势所迫，只得立即发动叛乱，在蒲阪称帝，并向自己管辖的河东各郡县发布文告，征兵调粮。
另一支主力宁东将军姚成都是后秦军中的一员猛将，果断地拒绝了这位前顶头上司的命令。遣使责问姚懿：“殿下你以皇家至亲的身份担当一方诸侯的重任，国家有难你不思拯救，反而想谋求非分之福！三位先祖的在天之灵能保佑你吗？我将马上集结义兵，讨伐叛逆，你就等着在黄河上相见吧！”
稍后，姚绍和姚成都的平叛军队开赴蒲阪城下。姚绍进入蒲阪，不费吹灰之力便平定了此次叛乱。孙畅被诛杀，姚懿被囚禁。
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